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應(yīng)用案例

BeaverBeads? IDA-Nickel用于研究促進(jìn)結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移的自噬相關(guān)蛋白ATG9B

2020.10.6 南方醫(yī)科深圳醫(yī)院病理學(xué)系李祖國教授研究團(tuán)隊在Cell Death & Differentiation 雜志上發(fā)表研究論文《MYH9-dependent polarization of ATG9B promotes colorectal cancer metastasis by accelerating focal adhesion assembly》。研究了ATG9B蛋白在結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)轉(zhuǎn)移中的作用,及尋找CRC轉(zhuǎn)移的潛在診斷標(biāo)志物和治療靶點。

結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是常見的消化道腫瘤之一,由于早期臨床癥狀不明顯,發(fā)現(xiàn)時常常是中晚期。自噬是一種進(jìn)化保守的正常細(xì)胞中監(jiān)視機(jī)制,它通過清除分解受損的細(xì)胞器和聚集的蛋白質(zhì),并將產(chǎn)生的基礎(chǔ)營養(yǎng)物質(zhì)重新利用。在結(jié)直腸癌中,自噬對腫瘤的促進(jìn)與抑制雙重作用廣泛得到認(rèn)可,因此,明確自噬對結(jié)直腸癌腫瘤細(xì)胞的作用,將為結(jié)直腸癌的治療提供更多的理論依據(jù)。



論文解析

2020.10.6 南方醫(yī)科深圳醫(yī)院病理學(xué)系李祖國教授研究團(tuán)隊在Cell Death & Differentiation (IF15.828雜志上發(fā)表研究論文MYH9-dependent polarization of ATG9B promotes colorectal cancer metastasis by accelerating focal adhesion assembly研究了ATG9B蛋白在結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)轉(zhuǎn)移中的作用,及尋找CRC轉(zhuǎn)移的潛在診斷標(biāo)志物和治療靶點。


本研究通過免疫組化、qRT-PCR、細(xì)胞侵襲和黏附實驗、His pulldown、IPWB、IF、流式細(xì)胞術(shù)等實驗方法,確定自噬相關(guān)蛋白9B (autophagy-related protein 9B, ATG9B)CRC轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵潛在靶基因,發(fā)現(xiàn)MYH9ATG9B關(guān)鍵的相互作用蛋白,ATG9BMYH9的結(jié)合通過降低它們與E3泛素連接酶的結(jié)合來增強(qiáng)彼此的穩(wěn)定性。在CRC細(xì)胞侵襲過程中,ATG9BMYH9的輔助下被運送到細(xì)胞邊緣,通過介導(dǎo)內(nèi)吞整合素β1和Talin-1的相互作用,加速局灶性黏附(FA)的組裝,促進(jìn)整合素β1的活化。總之,本研究強(qiáng)調(diào)了ATG9BCRC轉(zhuǎn)移中促進(jìn)黏附灶聚集的重要作用。ATG9BMYH9可以為預(yù)防CRC進(jìn)展提供一對潛在的治療靶點。

在此研究過程中,利用BeaverBeads?IDA-Nickel(Cat# 70501)純化細(xì)菌表達(dá)His標(biāo)記的ATG9B-Cd2蛋白(氨基酸298-438 (aa298-438)),后將ATG9B-Cd2His蛋白加入轉(zhuǎn)染MYH9-Flag293T細(xì)胞的裂解液中,通過pull-down實驗,利用anti-his磁珠拉出相互作用的兩個蛋白,進(jìn)行western blot檢測ATG9B和MYH9相互作用(如下圖):

Fig. 1 MYH9 interacts with ATG9B directly.

A. LoVo and SW620 cells were lysed and subjected to immunoprecipitation with anti-ATG9B antibody or rabbit IgG using silver staining. The red boxes represents the detected bands.

B. Endogenous ATG9B and MYH9 were immunoprecipitated in SW620 cells.

C. Exogenous ATG9BHis and MYH9Flag were immunoprecipitated in 293T cells.



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